MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 60963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017857	GCT	2	6	181203	181208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126073
3502	NC_017857	AAT	2	6	181498	181503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126073
3503	NC_017857	GCC	2	6	181571	181576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126073
3504	NC_017857	ACC	2	6	181598	181603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126073
3505	NC_017857	CATT	2	8	181648	181655	25 %	50 %	0 %	25 %	387126073
3506	NC_017857	CTG	2	6	181675	181680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126073
3507	NC_017857	CTA	2	6	181753	181758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126073
3508	NC_017857	CTGC	2	8	181830	181837	0 %	25 %	25 %	50 %	387126073
3509	NC_017857	T	6	6	181877	181882	0 %	100 %	0 %	0 %	387126073
3510	NC_017857	GCA	2	6	181899	181904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126073
3511	NC_017857	AATC	2	8	181925	181932	50 %	25 %	0 %	25 %	387126073
3512	NC_017857	CAC	2	6	181939	181944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126073
3513	NC_017857	ATAA	2	8	181964	181971	75 %	25 %	0 %	0 %	387126073
3514	NC_017857	CGC	2	6	181994	181999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126073
3515	NC_017857	TATCAA	2	12	182044	182055	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387126073
3516	NC_017857	ATC	2	6	182153	182158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126073
3517	NC_017857	ACTG	2	8	182184	182191	25 %	25 %	25 %	25 %	387126073
3518	NC_017857	AGT	2	6	182243	182248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126073
3519	NC_017857	TAT	2	6	182332	182337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126073
3520	NC_017857	GTT	2	6	182350	182355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126073
3521	NC_017857	CAG	2	6	182371	182376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126073
3522	NC_017857	ACT	2	6	182385	182390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126073
3523	NC_017857	TCCA	2	8	182444	182451	25 %	25 %	0 %	50 %	387126073
3524	NC_017857	GGC	2	6	182480	182485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126073
3525	NC_017857	CCTG	2	8	182505	182512	0 %	25 %	25 %	50 %	387126073
3526	NC_017857	AC	3	6	182530	182535	50 %	0 %	0 %	50 %	387126073
3527	NC_017857	GTTG	2	8	182591	182598	0 %	50 %	50 %	0 %	387126073
3528	NC_017857	AT	3	6	182638	182643	50 %	50 %	0 %	0 %	387126073
3529	NC_017857	GCT	2	6	182662	182667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126073
3530	NC_017857	T	6	6	182689	182694	0 %	100 %	0 %	0 %	387126073
3531	NC_017857	GACA	2	8	182813	182820	50 %	0 %	25 %	25 %	387126074
3532	NC_017857	GAC	2	6	182860	182865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126074
3533	NC_017857	TGATA	2	10	182914	182923	40 %	40 %	20 %	0 %	387126074
3534	NC_017857	TAA	2	6	183007	183012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126074
3535	NC_017857	TGC	2	6	183021	183026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126074
3536	NC_017857	CGA	2	6	183046	183051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126074
3537	NC_017857	CCGG	2	8	183099	183106	0 %	0 %	50 %	50 %	387126074
3538	NC_017857	TGT	2	6	183180	183185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126074
3539	NC_017857	CTGAA	2	10	183188	183197	40 %	20 %	20 %	20 %	387126074
3540	NC_017857	TAA	2	6	183218	183223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126074
3541	NC_017857	TGG	2	6	183271	183276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126074
3542	NC_017857	TTG	2	6	183293	183298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126074
3543	NC_017857	TGA	2	6	183467	183472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126074
3544	NC_017857	GTT	2	6	183589	183594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126074
3545	NC_017857	TGC	2	6	183612	183617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126074
3546	NC_017857	GTT	2	6	183637	183642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126074
3547	NC_017857	TGC	2	6	183666	183671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126074
3548	NC_017857	CCG	2	6	183691	183696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126074
3549	NC_017857	GCT	2	6	183739	183744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126074
3550	NC_017857	GCT	2	6	183783	183788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126075
3551	NC_017857	TGT	2	6	183812	183817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126075
3552	NC_017857	AT	3	6	183830	183835	50 %	50 %	0 %	0 %	387126075
3553	NC_017857	T	6	6	183835	183840	0 %	100 %	0 %	0 %	387126075
3554	NC_017857	TTTCAC	2	12	183922	183933	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387126075
3555	NC_017857	TGCTC	2	10	183987	183996	0 %	40 %	20 %	40 %	387126075
3556	NC_017857	TGC	2	6	184022	184027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126075
3557	NC_017857	CGA	2	6	184061	184066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126075
3558	NC_017857	ATC	2	6	184079	184084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126075
3559	NC_017857	GCC	2	6	184196	184201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126075
3560	NC_017857	AAC	2	6	184209	184214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126075
3561	NC_017857	ATT	2	6	184252	184257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126075
3562	NC_017857	CT	3	6	184277	184282	0 %	50 %	0 %	50 %	387126075
3563	NC_017857	GTGG	2	8	184283	184290	0 %	25 %	75 %	0 %	387126075
3564	NC_017857	ACT	2	6	184316	184321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_017857	ATT	2	6	184339	184344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_017857	ATA	2	6	184362	184367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_017857	CGA	2	6	184391	184396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_017857	TGT	2	6	184459	184464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_017857	GCA	2	6	184548	184553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126076
3570	NC_017857	AGTAA	2	10	184586	184595	60 %	20 %	20 %	0 %	387126076
3571	NC_017857	AAAAG	2	10	184634	184643	80 %	0 %	20 %	0 %	387126076
3572	NC_017857	TGC	2	6	184724	184729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126076
3573	NC_017857	GTA	2	6	184809	184814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126076
3574	NC_017857	AAT	2	6	184848	184853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126076
3575	NC_017857	CTG	2	6	184904	184909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126076
3576	NC_017857	ACA	2	6	184923	184928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126076
3577	NC_017857	ATA	3	9	185081	185089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126076
3578	NC_017857	CAG	2	6	185107	185112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126076
3579	NC_017857	TAC	2	6	185133	185138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126076
3580	NC_017857	TTG	2	6	185140	185145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126076
3581	NC_017857	T	6	6	185158	185163	0 %	100 %	0 %	0 %	387126076
3582	NC_017857	T	6	6	185180	185185	0 %	100 %	0 %	0 %	387126077
3583	NC_017857	GCCA	2	8	185232	185239	25 %	0 %	25 %	50 %	387126077
3584	NC_017857	TGA	2	6	185287	185292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126077
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3586	NC_017857	TCT	2	6	185383	185388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126078
3587	NC_017857	ACC	2	6	185391	185396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126078
3588	NC_017857	CAC	2	6	185419	185424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126078
3589	NC_017857	ACC	2	6	185470	185475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126078
3590	NC_017857	TC	3	6	185532	185537	0 %	50 %	0 %	50 %	387126078
3591	NC_017857	CCA	2	6	185568	185573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126078
3592	NC_017857	CCA	2	6	185609	185614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126078
3593	NC_017857	ATG	2	6	185632	185637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126078
3594	NC_017857	CAT	2	6	185647	185652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126078
3595	NC_017857	T	6	6	185742	185747	0 %	100 %	0 %	0 %	387126078
3596	NC_017857	ATTA	2	8	185833	185840	50 %	50 %	0 %	0 %	387126078
3597	NC_017857	ACC	2	6	185855	185860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126078
3598	NC_017857	CCAA	2	8	185866	185873	50 %	0 %	0 %	50 %	387126078
3599	NC_017857	AAT	2	6	185878	185883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126078
3600	NC_017857	A	7	7	186031	186037	100 %	0 %	0 %	0 %	387126078
3601	NC_017857	A	7	7	186078	186084	100 %	0 %	0 %	0 %	387126078
3602	NC_017857	GGCTCA	2	12	186092	186103	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387126078
3603	NC_017857	CAT	2	6	186120	186125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126078
3604	NC_017857	TGT	2	6	186207	186212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126078
3605	NC_017857	AGCCA	2	10	186321	186330	40 %	0 %	20 %	40 %	387126078
3606	NC_017857	ACC	2	6	186377	186382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126078
3607	NC_017857	GCT	2	6	186406	186411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_017857	A	6	6	186513	186518	100 %	0 %	0 %	0 %	387126079
3609	NC_017857	GACT	2	8	186652	186659	25 %	25 %	25 %	25 %	387126079
3610	NC_017857	TA	3	6	186752	186757	50 %	50 %	0 %	0 %	387126079
3611	NC_017857	CTG	2	6	186845	186850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126079
3612	NC_017857	TGC	2	6	187011	187016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126079
3613	NC_017857	T	6	6	187076	187081	0 %	100 %	0 %	0 %	387126079
3614	NC_017857	TAC	2	6	187142	187147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126079
3615	NC_017857	TGC	2	6	187269	187274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126079
3616	NC_017857	GT	3	6	187369	187374	0 %	50 %	50 %	0 %	387126079
3617	NC_017857	T	6	6	187379	187384	0 %	100 %	0 %	0 %	387126079
3618	NC_017857	ATA	2	6	187425	187430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126079
3619	NC_017857	GA	3	6	187493	187498	50 %	0 %	50 %	0 %	387126079
3620	NC_017857	AG	3	6	187525	187530	50 %	0 %	50 %	0 %	387126079
3621	NC_017857	TGAAC	2	10	187577	187586	40 %	20 %	20 %	20 %	387126079
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3623	NC_017857	A	7	7	187674	187680	100 %	0 %	0 %	0 %	387126079
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3995	NC_017857	ACC	2	6	208399	208404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126099
3996	NC_017857	GGA	2	6	208406	208411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387126099
3997	NC_017857	TA	3	6	208435	208440	50 %	50 %	0 %	0 %	387126099
3998	NC_017857	CAT	2	6	208494	208499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126099
3999	NC_017857	TGTT	2	8	208521	208528	0 %	75 %	25 %	0 %	387126099
4000	NC_017857	ATTT	2	8	208530	208537	25 %	75 %	0 %	0 %	387126099

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